Gmina Nekla znajduje się w środkowej części województwa wielkopolskiego w powiecie wrzesińskim. Położona nad Pojezierzem Wielkopolskim jest jedną z mniejszych gmin w województwie wielkopolskim. Graniczy od zachodu z gminą Kostrzyn, od północnego zachodu z gminą Pobiedziska (powiat poznański), od północnego wschodu z gminą Czerniejewo (powiat gnieźnieński), od wschodu z gminą Września (powiat wrzesiński), od południa i południowego zachodu z gminą Dominowo (powiat średzki). Miasto Nekla położone po obu stronach dwujezdniowej drogi nr 92 i w pobliżu linii kolejowej Berlin-Moskwa. Przez południową część gminy przebiega autostrada A-2 Świecko-Poznań-Warszawa. Najbliższy węzeł autostradowy znajduje się we Wrześni oddalonej jedynie 10km od Nekli. Przez gminę przepływa rzeka Maskawa, prawy dopływ Warty.